Juan Enrique Varona es Licenciado en Derecho y en Ciencias Económicas. Es Doctor en Derecho con calificación sobresaliente Cum Laude y Premio Extraordinario de Doctorado. Profesor titular de Derecho Financiero y Tributario de la Universidad de Cantabria de los años 1991 – 2002. Desde ese año es Catedrático de Derecho Financiero y Tributario de la Universidad de Cantabria.
En cuanto a su trayectoria investigadora, posee 7 sexenios de investigación (6 propiamente de investigación y 1 de transferencia del conocimiento) y 6 quinquenios de docencia. Ha sido visiting scholar en la Universidad de Berkeley durante un año, con beca del Ministerio. Además, ha realizado estancias de investigación con beca del Ministerio en las Universidades de Bolonia (6 meses), de Harvard (3 meses) y de Nápoles (3 meses).
Ha sido investigador principal de 8 proyectos de investigación I+D+i del Plan Nacional de tres años de duración cada uno. Ha dirigido 3 tesis doctorales y numerosos Congresos y Cursos sobre temas tributarios, así como ha impartido muchas decenas de conferencias en distintas Universidades e Instituciones financieras.
Ha publicado más de cien colaboraciones en libros y artículos en las mejores revistas de la especialidad.
Además de la trayectoria investigadora, ha ocupado cargos de responsabilidad: Vicerrector de Relaciones Institucionales y coordinación de Cantabria Campus Internacional de la Universidad de Cantabria (2012-2016). Vicedecano de la Facultad de Derecho (1998-2003) de la Universidad de Cantabria, Decano en funciones (2001) y subdirector del Departamento de Derecho Público (1993-1998). Fue presidente de la Comisión para la elaboración de los vigentes Estatutos de la Universidad de Cantabria (2011). Académico correspondiente de la Real Academia de Jurisprudencia y Legislación de España.